Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT2Q93063 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXT2Q93063 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXT2Q93063 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms