Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC4Q92889 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms