Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIFAP3Q92845 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms