Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3BQ92485 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3BQ92485 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms