Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSH3Q8TE77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSH3Q8TE77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms