Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX54Q8TDD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms