Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA6DQ8NFY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms