Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC9Q8NEP7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms