Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms