Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL23Q8NBE8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms