Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms