Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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