Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STAG2Q8N3U4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG2Q8N3U4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG2Q8N3U4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms