Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CA13Q8N1Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CA13Q8N1Q1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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