Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms