Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms