Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM25Q86YD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM25Q86YD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM25Q86YD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM25Q86YD3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM25Q86YD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM25Q86YD3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms