Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB4Q86W47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms