Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms