Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms