Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC3Q7Z5M5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC3Q7Z5M5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms