Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms