Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APTXQ7Z2E3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms