Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIAT1Q6ZQX7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms