Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms