Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP12Q6UXS9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP12Q6UXS9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms