Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms