Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms