Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms