Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms