Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RWDD4Q6NW29 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RWDD4Q6NW29 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms