Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR27Q6MZM9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRR27Q6MZM9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms