Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms