Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD16Q68DU8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms