Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms