Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LARP1BQ659C4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms