Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WSCD1Q658N2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms