Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1DP3Q658K8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1DP3Q658K8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms