Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA1Q5VX52 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA1Q5VX52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms