Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms