Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms