Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPANXN3Q5MJ09 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms