Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SAMD9Q5K651 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SAMD9Q5K651 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SAMD9Q5K651 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms