Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms