Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRDTQ58F21 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRDTQ58F21 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRDTQ58F21 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms