Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms