Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPAT3Q53EU6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPAT3Q53EU6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms