Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3BQ502W6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms