Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC57Q2TAC2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms