Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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